Автор комментариев к философским трудам Аристотеля (которого читал непосредственно по-гречески) и Аверроэса. Главный философский труд Фольяно «Убежище для колеблющихся» (Refugio de' dubitanti, 1583) утерян.
В трактате «Теория музыки» (Musica theorica; опубликован в Венеции в 1529 году), написанном в пифагорейских традициях, исследовал природу звука и музыкальные числа интервалов (в том числе проблему деления целого тона). Сопроводил математические изыскания ясными графическими иллюстрациями на монохорде.
В делении монохорда установил сверхчастичные отношения как приоритетные «согласно природе» (per naturam) и как соответствующие современной музыкальной практике, а именно 9:8 для большего целого тона, 10:9 для меньшего, 27:25 для большего полутона, 16:15 для меньшего, 25:24 для наименьшего полутона. Обе терции (дитон и полудитон) также установлены в сверхчастичных отношениях (соответственно, 5:4 и 6:5). Такое деление напоминает «синтонную» диатонику, как она изложена в «Гармонике» Птолемея, хотя прямой ссылки на грека нет. Разницу между большим и малым целыми тонами 81:80 Фольяно назвал коммой.
Из музыкальных сочинений Фольяно сохранился кводлибет «Fortuna d'un gran tempo» (на темы популярных мелодий из сборника фроттол Петруччи), и небольшая четырёхголосная месса в стиле фроттолы на неустановленный cantus firmus.