В 1970 г. был избран аудитором Счетной палаты Франции.
В 1978—1986 и в 1988—2002 гг. — депутат Национального собрания от Объединения в поддержку республики.
В 1979—1983 гг. — заместитель председателя регионального Совета Лотарингии.
В 1983—1997 гг. — мэр Эпиналя.
В 1981—1986 гг. — заместитель председателя Национального собрания.
В 1986—1988 гг. — министр социальных дел и занятости.
В 1992 г. возглавил кампанию против подписания Францией Маастрихтского договора.
В 1993—1997 гг. — председатель Национального собрания Франции. Был активным сторонником президента Жака Ширака.
Однако в 1997 г. их отношения ухудшились, сместив Алена Жюппе c поста лидера партии, Сеген публично заявил: «Я покончу с „ширакизмом“ в наших рядах и открою новую страницу в истории партии». Однако в затяжной политической борьбе он проиграл сторонникам Ширака в 1999 г.ушел с поста лидера Объединения в поддержку республики.
В 2001 г. проиграл на выбрах мэра Парижа, что во многом было обусловлено его отказом от союза с другими правыми партиями.
С 2004 г. — председатель Счётной палаты Франции.