Фелипе начал карьеру в клубе «Васко да Гама» в 1997 году. Он стал частью легендарной команды, которая за период с 1997 по 2000 год выиграла ряд международных и внутренних трофеев, в числе которых два чемпионата Бразилии, Кубок Либертадорес и Кубок Меркосур. Фелипе, действуя на позиции опорного полузащитника, отличался невероятно высоким уровнем футбольной техники, которая отмечалась даже в столь искушённой в этом плане бразильской прессе.
В 1998 году Вандерлей Лушембурго впервые вызвал Фелипе в сборную Бразилии. Игрок отличался непростым характером и после ухода Лушембурго долгое время не вызывался в расположение «Селесао».
В 2001—2003 гг. Фелипе сменил ряд клубов, среди которых был и европейский «Галатасарай». По возвращении в Бразилию вновь сумел выйти на высокий уровень, который демонстрировал в «Васко». Будучи игроком «Фламенго», вновь получил вызов в сборную. Карлос Алберто Паррейра включил игрока в состав на Кубок Америки. Фелипе внёс свой вклад в итоговый чемпионский титул.
С 2005 по 2010 год выступал в катарском клубе «Аль-Садд», после чего вернулся в «Васко да Гаму».