Фазлур Хан родился в Дакке, на территории тогдашнего Восточного Пакистана (современный Бангладеш). Обучался в университете Калькутты и Дакки. Окончив университет Дакки в 1951, выиграл премию Фулбрайта для талантливых студентов из колоний, которая позволила ему продолжить образование в США (университет штата Иллинойс). В течение трёх лет Фазлур Хан получил три диплома — магистра и доктора в структурном проектировании и магистра теоретической механике. В 1955 поступил работать на Skidmore, Owings and Merrill и с тех пор жил в Чикаго. Пройдя все ступени, к 1970 он стал полным партнёром фирмы (и оставался единственным партнёром «из инженеров»). За это время разработал и впервые реализовал типовые схемы несущих конструкций, ставшие стандартами в высотном строительстве — «несущая труба», «труба в трубе», «труба с наклонными брусьями» и т. п. Благодаря Хану, появилась возможность строить высотные дома сложных форм — пирамиды, неправильные призмы и т. п. (ранее, выбор форм был ограничен прямоугольными призмами).
Фазлур Хан лично спроектировал десятки зданий, в том числе:
Лауреат многих профессиональных премий — при жизни и посмертно, «Строитель 1972 года» по версии Engineering News-Record. Именем Фазлур Хана названа площадь в Чикаго, примыкающая к Sears Tower, а в самой башне в 1987 установлена его статуя.
Похоронен в Чикаго, на кладбище Грейсленд