Его инструментальная композиция «Cliffs of Dover» принесла ему премию Грэмми в номинации лучшее инструментальное рок исполнение в 1991 году.
С детства учился играть на пианино, в 11 лет взял в руки гитару. Уже в 15 лет был участником группы «Mariani», играющий психоделический рок. В 1974 году присоединился к группе «Electromagnets», которая не смогла привлечь внимание звукозаписывающих компаний и распалась в 1977 году.
Позже вместе с ударником Биллом Мэдоксом (Bill Maddox) и басистом Кайлом Броком (Kyle Brock) образовали трио. В конце 70х записали свой первый альбом Seven Worlds, однако из-за различных споров официально он был выпущен только в 1998 году.
В начале 80х Эрик работал в качестве сессионного гитариста с такими музыкантами как Кристофер Кросс, Кэрол Кинг и Кэт Стивенс.
В 1986 году Эрик выпустил свой самый почитаемый слушателями дебютный альбом "Tones", девять насыщенных обжигающими соло треков которого привлекли к Джонсону внимание гитаристов всего мира.
Полностью реализовать свой талант Эрику Джонсону удалось на альбоме "Ah Via Musicom" (1990). Гитарист впечатлил превосходным мелодизмом композиции "Trademark" и получившим Grammy инструменталом "Cliffs of Dover" и просто снес крышу своим пением на нескольких треках, включая сладко-жалобный "Desert Rose".
Композиция "Rain" с альбома "Alien Love Child (Live & Beyond)", вышедшего в 2001 году была номинированна в 2002 на Grammy как "Лучшее инструментальное поп-исполнение".
В 2002 Эрик ограничил возможность скачивания из Интернета своего альбома "Souvenir", но позже решил предложить фэнам черновую копию альбома.
Журнал Guitar Player пять раз называл Эрика лучшим гитаристом. The Austin Chronicle’s в 2000 году называет его лучшим гитаристом десятилетия. В апреле 2005 года на Austin Music Awards Джонсон получает премии "Музыкант года", "Лучший электрогитарист", и "Лучший акустический гитарист".
Летом 2005 года Джонсон выпустил диск "Bloom", очень высоко оцененный критиками. Чуть позже вышел его концертный альбом "Live From Austin TX", в очередной раз наглядно продемонстрировавший незаурядность таланта этого исполнителя.