Заслуженный деятель науки РСФСР (1973). Кавалер ордена Ленина (1966), награждена пятью медалями. Почётный гражданин города Кирова (1969).
Эмилия Штина родилась 18 июня 1910 года в селе Большая Пурга Вятской губернии (ныне на территории Удмуртии), в семье агронома. Училась в школе города Нолинска, в 1928 году поступила в Вятский пединститут, который окончила в 1931 году. В 1934—1937 годах училась в аспирантуре Московского государственного университета под руководством профессора К. И. Мейера, получила узкую специальность альголога. С 1941 года работает доцентом в Кировском сельхозинституте. В 1956 году защищает диссертацию на соискание степени доктора биологических наук, становится первой женщиной доктором наук в Кирове. В 1957 году получает научное звание профессора, с 1959 по 1976 год заведует кафедрой ботаники сельхозинститута.
18 лет работала депутатом местных Советов, 10 лет возглавляла депутатскую комиссию областного совета по охране природы. В 1967—1971 году была депутатом Верховного Совета РСФСР, где работала в комиссии по охране природы.
Долгие годы возглавляла кировские отделения Русского ботанического общества, Общества почвоведов России, Общества микробиологов России, а также Всероссийского общества охраны природы.
До последних дней продолжала работать на кафедре ботаники ВГСХА. Умерла 9 декабря 2007 года в Кирове на 98 году жизни.
Научную деятельность начала с изучения водорослей рек Вятки, Камы и других водоёмов Кировской области. Автор нового научного направления — почвенной альгологии. Под руководством Эмилии Штиной сформировался научный коллектив, признанный центром почвенной альгологии в стране. Опубликовала 270 научных публикаций, в том числе 5 монографий.
Штина выступала с докладами на Международных ботанических конгрессах в Великобритании, Ленинграде и др., на Международных конгрессах почвоведов в США, Румынии, Австралии, Москве. Под руководством Эмилии Штиной защищено 27 кандидатских диссертаций. Известна лекционной деятельностью, многократно читала курс почвенной альгологии в Московском, Ленинградском, Киевском университетах.