Будучи любителем, в 2004 году Эдуард Ворганов выиграл Мемориал Олега Дьяченко и Тур Арденн. С 2005 года он выступал за команду «Омнибайк Динамо Москва», за которую он выиграл Пять колец Москвы. Эта победа остаётся для Ворганова последней на данный момент. В 2007 году он перешёл в испанскую «Karpin - Galicia», за которую впервые проехал супервеломногодневку — Вуэльту. Ворганов участвовал в пяти Гранд Турах, но ни в одном не финишировал в первой двадцатке. В 2010 году он вернулся в Россию, в «Катюшу». На старте сезона Ворганов финишировал 7-м в Тур Даун Андер, летом он остановился в шаге от медалей чемпионата России, став 4-м.
2004
2005
2006
2007
2010