Родился в Багдаде в семье выходцев из города Негаванда ().
Как пишет французский исследователь Анри Корбен в своей работе «История исламской философии», Джунайд получил традиционное мусульманское образование у одного из выдающихся ученых эпохи — у Абу Тхаура аль-Кальби. В мистические суфийские доктрины его посвящал его дядя Сари ас-Сакати, а также аль-Харис аль-Мухасиби () и Мухаммад ибн Али аль-Касаб. Личность, проповеди и трактаты Джунайда имели первостепенное значение для суфиев Багдадской школы, а сам мыслитель получил среди суфиев прозвище «шейх ут-та?ифа» (араб. ??? ?????????) или «сэййид ут-та?ифа» (араб. ??? ?????????) — учитель общины. Умер в Багдаде, где прожил всю свою жизнь
По словам Корбена, сохранилось 15 трактатов Джунайда. В цитируемой работе французского востоковеда приводятся следующие:
По другим источникам, сохранилось только одно сочинение этого суфия — «Письма» (Раса?ил араб. ???????). В соответствии со своим названием сочинение представляет собой письма, адресованные частным лицам, а также трактаты-послания на темы суфизма, часть из которых написана в форме комментариев на отдельные аяты Корана.