Энтони учился в школе Сельвин Хаус (англ. Selwyn House School) в Монреале с 1994 по 1997 год. Окончил христианскую школу Эммануэль, выпуск 99-го. После Эммануэль, он посещал колледж Доусон, но был изгнан из баскетбольной команды.
В 2004 году он окончил колледж Джуниор Пенсакола во Флориде, однако, он нашёл своё признание на баскетбольной площадке. Был включён в первую сборную конференции в сезоне 2003/04, набирая в среднем 9 очков, 7 подборов и 3,5 блоков за игру.
Энтони сделал себе имя в Университете штата Невада, Лас-Вегас, когда его команда в первый же год его выступлений одержала 30 побед против 7 поражений в сезоне. Энтони был назван защитником года конференции Маунтин-Уэст и занял второе место в NCAA по блокшотам.
Энтони дебютировал в составе национальной канадской мужской баскетбольной команды летом 2008 года. Он оказывал огромное влияние на игру сборной на площадке, установив рекорды по количеству набранных очков и блокшотов для отдельных матчей. Однако, Канада не смогла пробиться на Олимпийские игры в Пекине. В составе сборной выступал на чемпионате Америки 2009 и чемпионате мира 2010.
16 июля 2010 года Джоел Энтони повторно подписал договор с «Майами Хит». .