В 1911 вступила в брак с эрцгерцогом Карлом, который после убийства Франца-Фердинанда стал наследником престола, а в 1916 — последним австрийским императором под именем Карла I.
После распада Австро-Венгрии в 1918 году Карл и Цита удалились в Швейцарию, а затем — на Мадейру, где в 1922 г. император ушёл из жизни. Цита Пармская пережила его на 67 лет, а Австрийскую империю — на 71 год. Вместе со старшим сыном, Отто (1912-2011), она стояла во главе дома Габсбургов.
В первые годы вдовства по предложению короля Альфонса XIII императрица вместе с 8 детьми занимала мадридский дворец Эль-Пардо, в 1929 г. переехала в Бельгию, во время Второй мировой войны уехала сначала в Нью-Йорк, а затем в Квебек. После войны поселилась в швейцарском замке Цицерс. Похоронена рядом с супругом в Императорском склепе Капуцинеркирхе.