Родился в 1 июля 1918(19180701) года в Армении в селе Торос в семье крестьянина. Армянин по национальности. После окончания сельской школы в педагогическое училище, которое в 1939 году с отличием закончил. Работал завучем средней школы в селе Заришат Амасийского района Армянской ССР. Член КПСС с 1944 года.
В Советской Армии с 1939 года, участник Великой Отечественной войны с июня 1941 года. Участвовал в боях за Кавказ, освобождении Кубани и Украины, особенно отличился своими действиями в мае 1944 года во время Крымской операции при освобождении Севастополя.
В наступательных боях по ликвидации севастопольского плацдарма врага в мае 1944 года помощник командира взвода 526-го стрелкового полка (89-я стрелковая дивизия 4-й Украинский фронт) старший сержант Арутюнян одним из первых бросился на штурм горы Горная, ворвался во вражеский дзот и гранатами уничтожил до 10 гитлеровцев. Взял на себя командование двумя взводами, командиры которых были убиты, успешно отразил контратаку, уничтожив до 40 вражеских солдат. Затем атаковал врага и выбил его из укрепленного района. В ходе боя было уничтожено 70 вражеских солдат, а 30 фашистов взяты в плен.
Указом Президиума Верховного Совета СССР от 24 марта 1945 года за образцовое выполнение боевых заданий командования на фронте борьбы с немецко-фашистским захватчиками и проявленные при этом мужество и героизм старшему сержанту Айдин Гукасовичу Арутюняну присвоено звание Героя Советского Союза с вручением ордена Ленина и медали «Золотая Звезда»(№ 6498).
После войны был уволен в запас. Жил в Ереване, работал в МВД Армянской ССР и начальником отдела горсовета.
С 1961 года майор Арутюнян в отставке. Женат, имеет троих детей и пять внуков.