Образование получил в Гёттингенском и Кёнигсбергском университетах, с 1866 работал в Готской обсерватории. Научные работы относятся к астрометрии. В 1888 г. издал новую обработку 3000 брадлеевских звезд. В течение многих лет каталог Ауверса-Брадлея оставался основой всех исследований о движении звезд (до появления «Предварительного генерального каталога» Л.Босса, содержавшего 6188 звезд). Изучал влияние спутников Сириуса и Проциона на движение главных звёзд. Определил параллакс Солнца по наблюдениям малых планет и прохождений Венеры по диску Солнца в 1874, 1882.
Отец известного химика Карла Фридриха фон Ауверса, дед физика Отто Артура Зигфрида фон Ауверса.
Кратер Ауверс на Луне назван в его честь.