Родился в семье суздальского священника, впоследствии протоиерея города Владимира.
В 1872 году окончил Владимирскую духовную семинарию, затем — Санкт-Петербургскую духовную академию.
Вплоть до 1902 года, служил в учебном ведомстве. Преподавал в Шуйском духовном училище, затем в Владимирской духовной семинарии.
Время рукоположения в священника неизвестно. Благодаря покровительству бывшего наставника по Казанской духовной академии митрополита Антония (Вадковского) с 28 марта 1902 года — служил протоиереем сначала на Васильевском острове Петербурга в Татианинской церкви Ларинской гимназии, затем вторым протоиереем в церкви Вознесения на Вознесенском проспекте. Был законоучителем Либавской, а затем Ларинской гимназии.
В 1916 году умиирает его супруга и сын Павел, а в 1918 году — сын Николая.
28 июня 1918 года принял монашество. В сане архимандрита назначен наместником Ипатьевского Костромского монастыря.
С 1 марта 1919 года — настоятель Калязинского Макарьевского монастыря.
16 июня 1919 года хиротонисан во епископа Слободского, викария Вятской епархии.
С 1919 по 1921 год управлял Вятской кафедрой, но, вероятно, он не был епархиальным архиереем, которым остался Никандр (Феноменов), а лишь периодически замещал своего кириарха, нередко отлучавшегося к патриарху Тихону в Москву.
С 19 марта 1920 года — епископ Тобольский и Сибирский. К Пасхе 1920 года возведён в сан архиепископа.
В 1921 году Тобольский епископ Николай после антибольшевистского восстания был арестован в Тобольске и приговорён к расстрелу. В таких условиях переходит в обновленчество. Был помилован.
25 августа 1923 года принят в общение из обновленчества и назначен архиепископом Тобольским.
С 24 января 1924 года — временно исполнял обязанности епископа Псковского и Порховского.
12 апреля 1925 года подписал акт о передаче высшей церковной власти митрополиту Крутицкому Петру (Полянскому).
С 1925 по 1928 год находился в ссылке в Псковской губернии.
В 1927 году уволен на покой по состоянию здоровья — сильно ухудшалось зрение. Нельзя исключить в качестве мотива при принятии этого решения и активность архиепископа Николая в противодействии обновленчеству.
С 24 апреля 1927 года по 29 ноября 1928 года — архиепископ Иваново-Вознесенский. Усилиями архиепископа Николая и его помощников весной 1929 года с Патриаршей церковью воссоединилось 14 приходов, ранее пребывавших в обновленчестве.
С декабря 1930 года — архиепископ Пермский и временно управляющий Иваново-Вознесенской епархией.
В мае 1931 года посетил Старую Руссу с целью приведения в порядок дел местного епархиального управления.
В 1931—1933 годах — архиепископ Полоцкий и Витебский. В это время по епархии прокатилась новая волна гонений: закрывались храмы, духовенство закрытых церквей попадало в тюрьмы, ссылки, на принудительные работы. В тячение трёх лет не было хиротоний. Самому архиепископу Николаю к весне 1932 года уже не было у кого исповедоваться.
23 марта 1932 года у архиепископа Николая была взята подписка о невыезде. На допросе архиепископ Николай так описывал состояние дел в епархии к 1932 году: «Непосредственно слышишь вопли, плач христиан о гонении на религию; видишь слезы плачущих земляков, родных, близких и своих духовных детей. Слаб и беден мой язык изобразить настоящее бедственное положение христианской религии. Просвета не видно, ни облегчения, ни утешения, ни улучшения и в недалеком будущем».
Постановлением Особого Совещания при Коллегии ОГПУ от 14 июля 1932 года по ст.72,76 УК БССР было принято решение о лишении права проживания архиепископа Николая в 12-ти пунктах и Уральской области с прикреплением к определенному месту жительства сроком на три года.
Летом 1932 года участвовал в сессии Временного при Заместителе Патриаршего Местоблюстителя Патриаршем Священном Синода как архиерей Полоцко-Витебской епархии.
21 октября 1932 года, данное постановление было отменено и 81-летнему владыке было разрешено проживать по всей территории СССР.
С февраля 1933 года — архиепископ Ижевский и Воткинский.
С начала июля 1933 года стал жаловаться на общую слабость, а 9 июля даже не смог дослужить Литургию.
Скончался 18 июля 1933 года. 19 июля 1933 года при участии всего духовенства Ильинской церкви, архиепископ Николай был погребён на Успенском кладбище Ижевска.