Родился в Перми в семье церковного певчего.
В 1981 году окончил среднюю школу.
В 1982—1984 годы — служба в Вооружённых силах СССР.
В 1984 году поступил в Московскую духовную семинарию, которую окончил по первому разряду в 1988 году. В том же году был принят в Московскую духовную академию; как студент дважды удостаивался патриаршей стипендии.
19 октября 1990 года, на 3-м курсе академии, в Покровском академическом храме был пострижен в монашество с именем Марк в честь евангелиста Марка. 21 ноября того же года был рукоположён в иеродиакона; 7 января 1991 года — в сан иеромонаха.
В 1992 году окончил МДА, защитив на кафедре истории Древней Церкви кандидатскую диссертацию на тему «Блаженный Диадох Фотикийский и его богословские и аскетические взгляды».
Решением Священного Синода от 12 августа 1992 года был назначен членом Русской духовной миссии в Иерусалиме.
В праздник Пятидесятницы 1997 года Патриархом Московским Алексием II в Троицком соборе Русской духовной миссии в Иерусалиме был возведён в сан игумена.
28 декабря 1999 года определением Священного Синода назначен заместителем председателя Отдела внешних церковных сношений Московского Патриархата. Курировал вопросы административно-хозяйственной работы Отдела и осуществлял практическое взаимодействие с государственными инстанциями России и других стран.
Указом Патриарха от 26 января 2000 года назначен настоятелем московского храма Св. Троицы в Хорошёве.
3 мая 2000 года митрополитом Смоленским и Калининградским Кириллом (Гундяевым) был возведён в сан архимандрита.
Указом Священного Синода от 26 декабря 2003 года определено быть епископом Егорьевским, викарием Московской епархии.
14 января 2004 года в храме Христа Спасителя в Москве был хиротонисан во епископа Патриархом Алексием и сонмом архиереев.
С 31 марта 2009 — Секретарь Московской Патриархии по зарубежным учреждениям и временно управляющий Венско-Австрийской и Венгерской епархиями.
1 февраля 2010 года возведён в сан архиепископа.