Родился 22 октября 1966 года в Нарви, Польша. Закончил электротехникум в Белостоке, работал электриком.
В 1987 году поступил в Супрасльский Благовещенский монастырь, где 19 августа 1987 года архиепископом Саввой был рукоположён в сан диакона. С 1987 по 1992 года — учился в Московской духовной академии. 10 августа 1989 году хиротонисан в иерея. В 1992 году закончил Московскую духовную академию со степенью магистра богословия. 17 декабря 1993 году архиепископом Саввой в Супрасльском Благовещенском монастыре был пострижен в монашество с наречением имени Иаков в честь св. апостола Иакова, брата Господня по плоти.
С 1995 года работал ассистентом в Варшавской христианской богословской академии на кафедре догматического и нравственного богословия. В 1992 году стал наместником Свято-Благовещенского монастыря в Супрасле и духовником Братства православной молодёжи. В 1994 году возведён в сан игумена.
11 мая 1998 году рукоположён в сан епископа Супрасльского. 30 марта 1999 года определением Архиерейского Собора и декретом архиепископа Саввы назначен епископом Белостокским и Гданьским. 22 мая 1999 года в Белостокском кафедральном соборе св. Николая состоялась интронизация владыки Иакова на Белостокско-Гданьскую кафедру.
16 июня 2008 года возведен в сан архиепископа.