В 1901 году окончил Казанскую Духовную Академию со степенью кандидата богословия.
Служил псаломщиком в Русской посольской церкви во Флоренция в 1902—1903 годах и Русской посольской церкви в Риме в 1903—1904 голах.
С 19 августа 1904 года — преподаватель в Тульской Духовной Семинарии. 13 октября 1905 года уволен от службы в Семинарии по болезни.
С 17 января по 7 июля 1907 года — надзиратель Московской Духовной Семинарии.
7 июля 1907 года принял монашеский постриг с именем Филипп.
С 27 октября 1907 по 16 августа 1908 года — помощник инспектора Московской Духовной Семинарии.
С 16 августа 1908 года иеромонах, инспектор Тифлисской Духовной Семинарии.
С 7 октября 1909 года инспектор Вифанской Духовной Семинарии в Сергиевом Посаде. С 30 января 1910 года — архимандрит, ректор Вифанской Духовной Семинарии.
С 22 июня 1912 года по 30 марта 1913 года — ректор Московская Духовная Семинарии.
С 30 марта 1913 по 16 мая 1916 года — настоятель Русской посольской церкви в Риме.
С 16 мая 1916 по 1918 год — ректор Кишинёвской Духовной Семинарии.
29 ноября 1920 года хиротониcан во епископа Ейского, викария Ставропольской епархии.
С 1922 года — епископ Балахнинский, викарий Нижегородской епархии.
С 1923 года в заключении и ссылке. В 1925—1926 годах проживал в Москве без права выезда.
В 1925 году уклонился в беглопоповство. Принёс покаяние. 12 апреля 1925 года подписал акт о передаче высшей церковной власти митрополиту Крутицкому Петру (Полянскому).
В 1926—1927 годах в ссылке в Тамбовской губерния.
С мая 1927 года — архиепископ Звенигородский, временно управляющий Московской епархией. С 18 мая 1927 года — член Временного Патриаршего Священного Синода при митрополите Сергии (Страгородском).
16 июля 1930 года рукоположил монаха Пимена (Извекова), будущего патриарха, во иеродиакона, а 12 января 1931 года — во иеромонаха.
18 февраля (по другим данным, 8 февраля) 1931 года был арестован по подозрению в том, что «информировал папу Римского о состоянии церквей в СССР», и в том, что якобы интервью митрополита Сергия 1930 г. было неискренним и должно последовать опровержение текста этого интервью.
В 1931—1934 годах находился в заключении в ИТЛ.
С мая 1936 года — архиепископ Владимирский.
9 сентября 1936 года арестован. Постановлением ОСО при НКВД от 21 сентября 1936 года осуждён на 3 года лишения свободы. 22 сентября умер в тюрьме. Похоронен в Иванове на местном городском кладбище.