Родился в Днепропетровске в семье военнослужащего.
После окончания средней школы в 1973 году поступил на биологический факультет Харьковского государственного университета, который окончил в 1979 году.
11 сентября 1980 года рукоположён во диакона.
28 сентября 1980 года был рукоположён архиепископом Курским и Белгородским Хризостомом в сан священника и назначен клириком кафедрального собора в Курске. Исполнял обязанности заведующего канцелярией Курского епархиального управления, в дальнейшем — секретаря.
В 1985 году секретарь Иркутского епархиального управления, настоятель Никольского храма в пос. Листвянки Иркутской области.
С 1986 года — клирик Полтавской епархии.
С 1987 года настоятель церкви в честь Рождества Иоанна Предтечи в селе Дудкин Гай Новосанжарского района Полтавской области.
В 1988 году окончил Московскую духовную семинарию.
С 1990 года — настоятель Николаевского собора в городе Комсомольске Кременчугского района Полтавской области.
В 1993 году был пострижен в монашество с именем Филипп — в честь священномученика Филиппа, митрополита Московского, — и, при сохранении должности настоятеля Свято-Николаевского собора в Комсомольске, назначен наместником Спасо-Преображенского монастыря в селе Мгарь Лубенского района Полтавской области, а также благочинным Кременчугского округа Полтавской епархии, возведён в сан игумена.
В 1994 году возведён в сан архимандрита.
В 1997 году, продолжая нести все возложенные на него Церковью труды, вступил в должность ректора Полтавского духовного училища и главного редактора газеты «Кременчуг православный».
В 1999 году окончил Киевскую духовную академию.
Решением Священного Синода Украинской Православной Церкви от 21 декабря 2001 года был определён епископом Полтавским и Кременчугским, преемником почившего в Боге 1 октября 2001 года митрополита Феодосия.
Архиерейская хиротония архимандрита Филиппа состоялось в Трапезном храме Киево-Печерской Лавры 30 декабря 2001 года. Рукоположение совершали митрополит Киевский и всея Украины Владимир, архиепископ Львовский Августин, епископы Житомирский Гурий, Хустский Иоанн, Сарненский Анатолий, Переяслав-Хмельницкий Митрофан, Вышгородский Павел.
На заседании Священного Синода Украинской Православной Церкви 23 апреля 2002 года епископ Филипп был назначен председателем вновь созданного Синодального отдела религиозного образования, катехизации и миссионерства.
В 2004 году нёс послушание временного члена Священного Синода Украинской Православной Церкви.
28 июля 2006 года был возведён в сан архиепископа.
14 ноября 2007 года Священный Синод Украинской Православной Церкви принял решение преобразовать Полтавскую и Кременчугскую епархию, выделив из её состава Кременчугскую и Хорольскую епархию. Синод постановил сохранить управление преобразованной Полтавской епархией, а также должности ректора Полтавской Миссионерской Духовной Семинарии и наместника Спасо-Преображенского Мгарского мужского монастыря за архиепископом Филиппом, присвоив ему титул «Полтавский и Миргородский».
25 декабря 2007 года решением Специализированного Учёного Совета Ужгородской Украинской Богословской Академии имени святых Кирилла и Мефодия присвоена учёная степень доктора богословия архиепископу Полтавскому и Миргородскому Филиппу за диссертацию на тему «Миссионерская и просветительская деятельность Спасо-Преображенского Мгарского монастыря в историческом контексте (XVII—XXI века)».
Решением Священного Синода Украинской Православной Церкви от 8 мая 2008 года Синодальный отдел религиозного образования, катехизации и миссионерства был разделен на два Синодальных отдела — миссионерский отдел и отдел религиозного образования и катехизации; архиепископ Филипп назначен председателем Миссионерского отдела при Священном Синоде Украинской Православной Церкви.
10 февраля 2011 года Синодом УПЦ назначен председателем Синодального отдела религиозного образования и катехизации Украинской Православной Церкви.