Родился в Пьетро-ди-Горициа (словен. ). В 1867 году получил ученую степень в области математики и инженерного дела в Падуанском университете.
В 1879 году женился на Джованне Кольбачини. Два сына, младший сын, Джорджо Абетти также стал астрономом.
В 1868—1893 годах работал ассистентом в обсерватории в Падуе.
В 1894 году стал директором обсерватории Арчетри, которую сделал одной из ведущих в Европе, и профессором Флорентийского университета.
Ушел в отставку в 1921 году, но продолжил исследования.
Ещё в Падуе сделал большое число наблюдений астероидов, комет и покрытий звёзд.
В 1874 году участвовал в экспедиции в Индию, руководимой Пьетро Таччини, целью которой было наблюдение прохождения Венеры по диску Солнца при помощи спектроскопа.
Был членом Национальной академии деи Линчеи и Королевского астрономического общества.
В честь Антонио Абетти и его сына Джорджо Абетти названы кратер Абетти на Луне и астероид 2646 Abetti.