Окончил Московский физико-технический институт в 1971 году и аспирантуру МФТИ в 1974 г. Профессор, заведующий кафедрой вакуумной электроники МФТИ. С 1991 года — также заведующий лабораторией Института радиотехники и электроники Российской академии наук (ИРЭ РАН)
А. С. Бугаёв — член экспертного совета ВАК и ряда учёных советов. Заместитель председателя комиссии по работе с научной молодежью РАН. Член редколлегий ряда научных журналов. Член IEEE. Действительный член Российской академии наук по отделению информатики, вычислительной техники и автоматизации с 2000 года.