Родился в дворянской семье. Окончил Московский институт востоковедения (1925). В 1931 опубликовал монографию «Индонезия. Социально-экономические очерки», первый в СССР научный труд об Индонезии, в котором освещались вопросы истории, экономики и культуры этой страны. Наряду с государствами Юго-Восточной Азии исследовал страны Латинской Америки. В 1943 защитил докторскую диссертацию «Филиппинская Республика и американский империализм». Опубликовал свыше 200 научных работ. Работал научным сотрудником Коммунистического университета трудящихся Востока, в Институте истории АН СССР (1938—1945; 1957—1968), в Институте всеобщей истории АН СССР (с 1968), в Институте востоковедения АН СССР (1950—1956). Вёл педагогическую деятельность — преподавал в Московском государственном университете (с 1937), в Академии общественных наук при ЦК КПСС (с 1946). Участвовал в подготовке учебников и учебных пособий по истории стран Востока для вузов. Был председателем Национального комитета историков Советского Союза, членом Главной редакции Советской исторической энциклопедии (с 1958), членом редакционной коллегии и главным редактором журнала «Новая и новейшая история». Был избран председателем XIII международного конгресса исторических наук (Москва, август 1970 г.), а также вице-президентом и затем президентом Международного комитета исторических наук. Был членом Советского комитета защиты мира, Комитета солидарности стран Азии и Африки, возглавлял общество «СССР — Индонезия» (с 1958). Инициатор многих научных начинаний (серия «Памятники исторической мысли» и др.). Инициатор проведения малайско-индонезийских чтений в Институте восточных языков при МГУ (1967), на основе которых позднее было создано Общество «Нусантара». В Институте стран Азии и Африки при МГУ ежегодно в день его рождения 1 апреля проводятся Губеровские чтения.