Учился у Зигфрида Дена (1853—1856). С 1881 г. преподавал в Консерватории Шарвенки, затем в берлинской Академии искусств (среди его учеников, в частности, были Ян Сибелиус, Оскар Мериканто, Карл Кребс). В 1890 г. возглавил Королевский придворный хор.
Как композитор добился своего первого успеха в 1861 г., когда его первая симфония получила премию венского Общества друзей музыки. Был известен, главным образом, своей церковной и хоровой музыкой, в том числе Мессой си-бемоль минор (1878). Оставил также фортепианный квинтет, ряд сочинений для скрипки с оркестром, песни, неоконченную оперу «Лорелея».
Внук Беккера — композитор Гюнтер Рафаэль.