После того, как Карл IX занял престол, дю Перрон сохранил свободный доступ в его личные покои. Среди итальянцев, окружавших Екатерину Медичи, он занял самое видное место. Постепенно к нему перешли придворные должности покойных герцога де Роаннэ и маршала де Вьёйвиля.
Карл IX посылал дю Перрона с затруднительными дипломатическими поручениями за рубеж; именно он представлял короля на брачной церемонии с участием Елизаветы Австрийской.
Во время Религиозных войн он участвовал в сражении при Сен-Дени (1567), где командовал парижским ополчением; был при Жарнаке (1569), Монконтуре (1569) и осаде Пуатье (1569). Современники единодушно приписывали ему (даже в большей степени, чем другому итальянцу, Лодовико Гонзага) замысел резни гугенотов в Варфоломеевскую ночь.
После этой трагедии влияние Гонди на короля пошло на убыль. Он сопровождал герцога Анжуйского в Польшу, боролся с Монтгомери за Бель-Иль, в 1573 году участвовал в осаде Ла-Рошели и усмирял волнения в Салуццо. Супруга его тем временем держала литературный салон в столице.
Маршал де Рец обеспечил своей фамилии надёжное будущее при дворе. Из его сыновей и братьев трое занимали столичную епископскую кафедру, а внук, кардинал де Рец, прославился как крупнейший деятель Фронды. Подробнее о его родственниках см. статью Гонди.